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Please cite:
Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server.
Kelley LA & Sternberg MJE Nature Protocols. 4, 363 - 371 (2009) [pdf]
Email: | clockha2@gmu.edu |
Job Code: | 809450c270b835c7 |
Description: | P42898___ |
Date: | Mon Nov 14 04:49:59 GMT 2011 |
Secondary Structure Prediction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Index | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 470 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 480 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 520 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 530 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 540 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 550 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 560 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 570 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 580 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 590 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 600 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 610 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 620 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 630 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 640 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 650 | . | . | . | . | . | |
Query Sequence | M | V | N | E | A | R | G | N | S | S | L | N | P | C | L | E | G | S | A | S | S | G | S | E | S | S | K | D | S | S | R | C | S | T | P | G | L | D | P | E | R | H | E | R | L | R | E | K | M | R | R | R | L | E | S | G | D | K | W | F | S | L | E | F | F | P | P | R | T | A | E | G | A | V | N | L | I | S | R | F | D | R | M | A | A | G | G | P | L | Y | I | D | V | T | W | H | P | A | G | D | P | G | S | D | K | E | T | S | S | M | M | I | A | S | T | A | V | N | Y | C | G | L | E | T | I | L | H | M | T | C | C | R | Q | R | L | E | E | I | T | G | H | L | H | K | A | K | Q | L | G | L | K | N | I | M | A | L | R | G | D | P | I | G | D | Q | W | E | E | E | E | G | G | F | N | Y | A | V | D | L | V | K | H | I | R | S | E | F | G | D | Y | F | D | I | C | V | A | G | Y | P | K | G | H | P | E | A | G | S | F | E | A | D | L | K | H | L | K | E | K | V | S | A | G | A | D | F | I | I | T | Q | L | F | F | E | A | D | T | F | F | R | F | V | K | A | C | T | D | M | G | I | T | C | P | I | V | P | G | I | F | P | I | Q | G | Y | H | S | L | R | Q | L | V | K | L | S | K | L | E | V | P | Q | E | I | K | D | V | I | E | P | I | K | D | N | D | A | A | I | R | N | Y | G | I | E | L | A | V | S | L | C | Q | E | L | L | A | S | G | L | V | P | G | L | H | F | Y | T | L | N | R | E | M | A | T | T | E | V | L | K | R | L | G | M | W | T | E | D | P | R | R | P | L | P | W | A | L | S | A | H | P | K | R | R | E | E | D | V | R | P | I | F | W | A | S | R | P | K | S | Y | I | Y | R | T | Q | E | W | D | E | F | P | N | G | R | W | G | N | S | S | S | P | A | F | G | E | L | K | D | Y | Y | L | F | Y | L | K | S | K | S | P | K | E | E | L | L | K | M | W | G | E | E | L | T | S | E | E | S | V | F | E | V | F | V | L | Y | L | S | G | E | P | N | R | N | G | H | K | V | T | C | L | P | W | N | D | E | P | L | A | A | E | T | S | L | L | K | E | E | L | L | R | V | N | R | Q | G | I | L | T | I | N | S | Q | P | N | I | N | G | K | P | S | S | D | P | I | V | G | W | G | P | S | G | G | Y | V | F | Q | K | A | Y | L | E | F | F | T | S | R | E | T | A | E | A | L | L | Q | V | L | K | K | Y | E | L | R | V | N | Y | H | L | V | N | V | K | G | E | N | I | T | N | A | P | E | L | Q | P | N | A | V | T | W | G | I | F | P | G | R | E | I | I | Q | P | T | V | V | D | P | V | S | F | M | F | W | K | D | E | A | F | A | L | W | I | E | R | W | G | K | L | Y | E | E | E | S | P | S | R | T | I | I | Q | Y | I | H | D | N | Y | F | L | V | N | L | V | D | N | D | F | P | L | D | N | C | L | W | Q | V | V | E | D | T | L | E | L | L | N | R | P | T | Q | N | A | R | E | T | E | A | P |
psipred   | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | h | h | h | h | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | e | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
jnet   | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | h | h | h | h | e | e | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | e | e | e | c | c | e | e | e | e | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
sspro   | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | e | e | e | e | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | e | e | e | e | c | e | e | e | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
Consensus   | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | h | h | e | e | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | e | e | e | c | c | e | e | e | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | e | e | e | e | e | e | e | c | c | c | c | c | c | c | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | h | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c | c |
Cons_prob   | 8 | 6 | 6 | 6 | 6 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 8 | 7 | 7 | 7 | 7 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | 6 | 6 | 6 | 6 | 7 | 6 | 6 | 6 | 6 | 7 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 8 | 5 | 5 | 5 | 6 | 7 | 8 | 8 | 7 | 8 | 8 | 8 | 7 | 7 | 6 | 5 | 7 | 9 | 9 | 4 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 7 | 5 | 8 | 9 | 9 | 9 | 6 | 5 | 5 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 5 | 7 | 9 | 9 | 7 | 7 | 9 | 9 | 7 | 6 | 4 | 7 | 8 | 9 | 9 | 9 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 6 | 4 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 7 | 9 | 9 | 8 | 5 | 7 | 7 | 6 | 6 | 5 | 5 | 7 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 9 | 9 | 8 | 7 | 9 | 9 | 9 | 8 | 4 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 8 | 8 | 8 | 7 | 6 | 5 | 7 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 7 | 9 | 9 | 8 | 6 | 5 | 7 | 7 | 7 | 5 | 5 | 7 | 8 | 8 | 8 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 5 | 8 | 9 | 8 | 8 | 8 | 9 | 8 | 6 | 4 | 5 | 6 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 9 | 9 | 8 | 6 | 5 | 8 | 8 | 5 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | 7 | 6 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 7 | 5 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 7 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 6 | 8 | 9 | 9 | 7 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 9 | 9 | 9 | 8 | 4 | 7 | 8 | 8 | 6 | 4 | 8 | 8 | 7 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 4 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 7 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 6 | 6 | 7 | 8 | 9 | 8 | 7 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | 6 | 5 | 4 | 7 | 7 | 7 | 5 | 6 | 8 | 8 | 6 | 4 | 6 | 6 | 6 | 5 | 5 | 6 | 7 | 5 | 6 | 6 | 8 | 8 | 9 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 7 | 6 | 6 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 8 | 7 | 8 | 7 | 7 | 6 | 4 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 6 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 9 | 8 | 6 | 5 | 4 | 5 | 5 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 8 | 7 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 5 | 8 | 9 | 4 | 8 | 9 | 7 | 7 | 8 | 8 | 7 | 7 | 6 | 8 | 8 | 7 | 8 | 8 | 9 | 9 | 8 | 4 | 4 | 5 | 6 | 7 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 7 | 8 | 6 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 8 | 9 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 5 | 8 | 9 | 9 | 5 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 5 | 7 | 9 | 8 | 8 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 9 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 6 | 8 | 8 | 7 | 6 | 6 | 6 | 8 | 9 | 8 | 5 | 6 | 5 | 6 | 7 | 3 | 5 | 5 | 4 | 7 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | 7 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 8 | 8 | 6 | 5 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 5 | 7 | 9 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 5 | 5 | 7 | 6 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 4 | 8 | 8 | 7 | 8 | 8 | 6 | 4 | 7 | 7 | 8 | 8 | 8 | 9 | 9 | 8 | 9 | 9 | 9 | 8 | 6 | 6 | 8 | 8 | 7 | 6 | 7 | 8 | 7 | 6 | 6 | 8 | 9 | 9 |
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Disorder Prediction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Index | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 470 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 480 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 520 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 530 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 540 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 550 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 560 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 570 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 580 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 590 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 600 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 610 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 620 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 630 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 640 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 650 | . | . | . | . | . | |
Disopred   | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | o | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | o | d | o | o | d | d | o | o | d | d | d | d | o | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | o | d | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | o | d | d | d | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | o | o | d | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | o | d | d | o | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d | d |
Diso_prob  | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 6 | 9 | 9 | 8 | 7 | 7 | 7 | 7 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 8 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 4 | 5 | 6 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 2 | 6 | 8 | 9 | 8 | 7 | 8 | 8 | 9 | 8 | 7 | 8 | 6 | 6 | 2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | 3 | 3 | 3 | 0 | 2 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 1 | 0 | 2 | 1 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 1 | 1 | 4 | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 5 | 5 | 8 | 8 | 7 | 4 | 4 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 5 | 4 | 7 | 7 | 8 | 9 | 8 | 8 | 7 | 7 | 7 | 9 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 | 8 | 7 | 5 | 3 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 7 | 6 | 5 | 4 | 6 | 6 | 8 | 6 | 5 | 3 | 3 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 2 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 2 | 5 | 4 | 6 | 7 | 6 | 6 | 6 | 8 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 2 | 1 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 5 | 6 | 7 | 6 | 7 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | 1 | 1 | 3 | 1 | 4 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 4 | 3 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 4 | 2 | 3 | 4 | 4 | 2 | 4 | 5 | 2 | 6 | 7 | 6 | 6 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 1 | 5 | 2 | 2 | 7 | 4 | 2 | 2 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 2 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 3 | 1 | 2 | 2 | 4 | 6 | 6 | 4 | 5 | 6 | 6 | 7 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 | 9 |
Prosite |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |
Fold Recognition | |||||||||||||||
View Alignments | SCOP Code | View Model | E-value | Estimated Precision | BioText | Fold/PDB descriptor | Superfamily | Family | (beta-test) | ||||||
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![]() |
d1b5ta_ (length:275) 32% i.d. |
|
6.9e-38 | 100 % | n/a | TIM beta/alpha-barrel | FAD-linked oxidoreductase | Methylenetetrahydrofolate reductase | n/a | ||||||
![]() |
c2fmnB_ (length:304) 29% i.d. |
|
1e-37 | 100 % | n/a | PDB header:oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule:5,10-methylenetetrahydrofolate reductase; | PDBTitle: ala177val mutant of e. coli methylenetetrahydrofolate2 reductase complex with ly309887 | n/a | ||||||
![]() |
d1v93a_ (length:292) 37% i.d. |
|
1.2e-37 | 100 % | n/a | TIM beta/alpha-barrel | FAD-linked oxidoreductase | Methylenetetrahydrofolate reductase | n/a | ||||||
![]() |
d1qopa_ (length:267) 10% i.d. |
|
0.016 | 95 % | n/a | TIM beta/alpha-barrel | Ribulose-phoshate binding barrel | Tryptophan biosynthesis enzymes | n/a | ||||||
![]() |
c2v8zC_ (length:343) 11% i.d. |
|
0.016 | 95 % | n/a | PDB header:lyase | Chain: C: PDB Molecule:yage; | PDBTitle: crystal structure of yage, a prophage protein belonging to2 the dihydrodipicolinic acid synthase family from e. coli3 k12 | n/a | ||||||
![]() |
d2liva_ (length:344) 11% i.d. |
|
0.017 | 95 % | n/a | Periplasmic binding protein-like I | Periplasmic binding protein-like I | L-arabinose binding protein-like | n/a | ||||||
![]() |
c2ekcA_ (length:262) 12% i.d. |
|
0.017 | 95 % | n/a | PDB header:lyase | Chain: A: PDB Molecule:tryptophan synthase alpha chain; | PDBTitle: structural study of project id aq_1548 from aquifex aeolicus vf5 | n/a | ||||||
![]() |
d1o5ka_ (length:295) 12% i.d. |
|
0.019 | 95 % | n/a | TIM beta/alpha-barrel | Aldolase | Class I aldolase | n/a | ||||||
![]() |
d1wa3a1 (length:202) 10% i.d. |
|
0.019 | 95 % | n/a | TIM beta/alpha-barrel | Aldolase | Class I aldolase | n/a | ||||||
![]() |
c2ehhE_ (length:294) 14% i.d. |
|
0.021 | 95 % | n/a | PDB header:lyase | Chain: E: PDB Molecule:dihydrodipicolinate synthase; | PDBTitle: crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from2 aquifex aeolicus | n/a |